#!/bin/bash #PBS -S /bin/bash #PBS -j oe #PBS -o /lfs/h2/emc/ptmp/yali.mao/working_wafs/log.wafs_upp #PBS -N wafs_upp #PBS -l debug=true #PBS -l walltime=00:15:00 #PBS -l select=1:mpiprocs=126:ompthreads=1:ncpus=126 #PBS -l place=vscatter:exclhost #PBS -q debug #PBS -A GFS-DEV ##PBS -V set -x # specify computation resource export MP_LABELIO=yes export MPIRUN='mpiexec -l -n 126 -ppn 126 --cpu-bind depth --depth 1' echo "starting time $PBS_JOBNAME" ############################################ # Set up the HOME directory ############################################ export NWROOT=/lfs/h2/emc/vpppg/noscrub/yali.mao/git export HOMEwafs=${HOMEwafs:-${NWROOT}/WAFS.fork} # specify user's own post working directory for testing export EXECwafs=$HOMEwafs/exec # specify variables if testing post in non gfs structure environment #export PARMwafs=$HOMEwafs/parm/upp #export POSTGRB2TBL=$PARMwafs/params_grib2_tbl_new ############################################ # Loading module ############################################ source $HOMEwafs/versions/run.ver module reset source $HOMEwafs/dev/modulefiles/upp.sh #export WGRIB2=/u/Wen.Meng/bin/wgrib2 module list ############################################ # Modify ROOT after loading modules ############################################ export DBNROOT=${UTILROOT}/fakedbn ############################################ # Define envir ############################################ ### envir: prod/dev/para/bkup/ges/test bkup2/ges2/para2/prod2/prd_p6 export envir=prod ############################################ # set NET RUN ############################################ ### NET: gfs/para/parallel-test/nam/rap/ dump/ens/nawips/nesdis/ export NET=wafs export RUN=wafs ############################################ # user defined ############################################ export cyc=${cyc:-00} export cycle=t${cyc}z export fhr=006 export PDY=$(cut -c 7-14 $COMROOT/date/t${cyc}z) # wafs_grib2 for generating global WAFS on grid 45 export job=wafs_upp_${cyc} export pid=${pid:-$$} export jobid=${job}.${pid} USER=$(whoami) ############################################ # SENDCOM=YES--Copy output file to /com # SENDDBN=YES--Alert output file to TOC # KEEPDATA=NO--Remove temporary working ############################################ export SENDCOM=YES export SENDDBN=NO export KEEPDATA=YES ############################################ # Define DATA, COMOUT and COMIN ############################################ export COMROOT=/lfs/h2/emc/ptmp/$USER/wafs_dwn/$envir/com export COMPATH=${COMPATHgfs:-/lfs/h1/ops/prod/com/gfs} DATAroot=/lfs/h2/emc/ptmp/$USER/working_wafs ############################################ # run the job ############################################# export DATA=$DATAroot/upp.f$fhr.${jobid} $HOMEwafs/jobs/JWAFS_UPP echo $?