#!/bin/sh

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# Ensure environment is defined.
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set +x
echo cyc is ${cyc:?} 
echo envir is ${envir:?} 
echo rtofs_glo_ver is ${rtofs_glo_ver:?}
echo DATAROOT is $DATAROOT

export PS4='$SECONDS + '
date
env
set -xa

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# Specify NET and RUN Name and model ID
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export NET=rtofs
export RUN=rtofs
export modID=glo
export RUN_MODE=analysis
export HYCOM_EXPT=930

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# SETUP RUN VARIABLES
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export forcing_only=TRUE

export mycyc='00'
export cycle=t${mycyc}z

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 # obtain unique process id (pid) and make temp directories
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export DATA=${DATA:-${DATAROOT}/${jobid}}
mkdir $DATA
cd $DATA

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# Determine Job Output Name on System
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export pgmout="OUTPUT.$$"

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# Specify Execution Areas
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#export HOMErtofs=${HOMErtofs:-${NWROOT:?}/${RUN}_${modID}.${rtofs_glo_ver}}
export EXECrtofs=${HOMErtofs}/exec
export PARMrtofs=${HOMErtofs}/parm
export FIXrtofs=${HOMErtofs}/fix
export USHrtofs=${HOMErtofs}/ush

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# Set up the UTILITIES
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export USHutil=${UTILROOT:?}/ush
export EXECutil=${UTILROOT:?}/exec
export utilexec=$EXECutil    # needed by some scripts in USHutil

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# Run setpdy and initialize PDY variables
# For any retrospecitve run, set the PDY in the ECF script
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setpdy.sh
. ./PDY

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# Define Input/Output/Restart directories
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export GETGES_COM=${GETGES_COM:-$(compath.py ${envir}/com/gfs/${gfs_ver})}
export COMIN=${COMIN:-$(compath.py ${envir}/com/${NET}/${rtofs_glo_ver})/${RUN}.${PDY}}
export COMOUT=${COMOUT:-$(compath.py -o ${NET}/${rtofs_glo_ver})/${RUN}.${PDY}}
mkdir -m 775 -p $COMOUT
test -d $COMOUT || mkdir -p $COMOUT

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# Define model grid
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export inputgrid=navy_0.08
export useslp=NO # YES or NO, use sea level pressure

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# Run the config file to set up specific model variables if needed
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. $PARMrtofs/${RUN}_${modID}.${inputgrid}.config

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# Set up analysis_pre parameters
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eval fcstdays="\$analdays"

#################################################################
#  Send a message indicating the start of the job
#################################################################
msg="JOB $job HAS BEGUN on $(hostname)"
postmsg "$msg"

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# execute the script
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sh ${HOMErtofs}/scripts/ex${RUN}_${modID}_${RUN_MODE}_pre.sh

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cat $pgmout
cp -p $pgmout $COMOUT/${RUN}_${modID}.t${cyc}z.${RUN_MODE}_pre.$(basename $pgmout)

msg="JOB $job HAS COMPLETED NORMALLY."
postmsg "$msg"

cd $DATAROOT
if [ "$KEEPDATA" != YES ]; then
  rm -rf $DATA
fi

date