#!/bin/ksh
set -x

export RUN_ENVIR=${RUN_ENVIR:-"nco"}
export PS4='$SECONDS + '
date


#############################
# Source relevant config files
#############################
export EXPDIR=${EXPDIR:-$HOMEgfs/parm/config}
configs="base ecen"
config_path=${EXPDIR:-$NWROOT/gfs.${gfs_ver}/parm/config}
for config in $configs; do
    . $config_path/config.$config
    status=$?
    [[ $status -ne 0 ]] && exit $status
done


##########################################
# Source machine runtime environment
##########################################
. $HOMEgfs/env/${machine}.env ecen
status=$?
[[ $status -ne 0 ]] && exit $status


##############################################
# Obtain unique process id (pid) and make temp directory
##############################################
export pid=${pid:-$$}
export outid=${outid:-"LL$job"}
export DATA=${DATA:-${DATAROOT}/${jobid:?}}
mkdir -p $DATA
cd $DATA


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# Run setpdy and initialize PDY variables
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export cycle="t${cyc}z"
setpdy.sh
. ./PDY


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# Determine Job Output Name on System
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export pgmout="OUTPUT.${pid}"
export pgmerr=errfile


##############################################
# Set variables used in the exglobal script
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export CDATE=${CDATE:-${PDY}${cyc}}
export CDUMP=${CDUMP:-${RUN:-"gdas"}}
if [ $RUN_ENVIR = "nco" ]; then
    export ROTDIR=${COMROOT:?}/$NET/$envir
fi


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# Begin JOB SPECIFIC work
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GDATE=$($NDATE -$assim_freq $CDATE)
gPDY=$(echo $GDATE | cut -c1-8)
gcyc=$(echo $GDATE | cut -c9-10)
GDUMP=${GDUMP:-"gdas"}

export CASE=$CASE_ENKF


EUPD_CYC=$(echo ${EUPD_CYC:-"gdas"} | tr a-z A-Z)
if [ $EUPD_CYC = "GFS" ]; then
    CDUMP_ENKF="gfs"
else
    CDUMP_ENKF=$CDUMP
fi

export OPREFIX="${CDUMP}.t${cyc}z."
export APREFIX="${CDUMP}.t${cyc}z."
export APREFIX_ENKF="${CDUMP_ENKF}.t${cyc}z."
export GPREFIX="${CDUMP}.t${gcyc}z."
export GSUFFIX=${GSUFFIX:-$SUFFIX}
export ASUFFIX=${ASUFFIX:-$SUFFIX}

if [ $RUN_ENVIR = "nco" -o ${ROTDIR_DUMP:-NO} = "YES" ]; then
    export COMIN_OBS=${COMIN_OBS:-$ROTDIR/$RUN.$PDY/$cyc}
    export COMIN_GES_OBS=${COMIN_GES_OBS:-$ROTDIR/$GDUMP.$gPDY/$gcyc}
else
    export COMIN_OBS="$DMPDIR/$CDATE/$CDUMP"
    export COMIN_GES_OBS="$DMPDIR/$GDATE/$GDUMP"
fi

# COMIN, COMIN_ENS and COMIN_GES_ENS are used in exglobal script
# TO DO: Map NCO's directory into these variables
export COMIN="$ROTDIR/$CDUMP.$PDY/$cyc"
export COMIN_ENS="$ROTDIR/enkf$CDUMP_ENKF.$PDY/$cyc"
export COMOUT_ENS="$ROTDIR/enkf$CDUMP.$PDY/$cyc"
export COMIN_GES_ENS="$ROTDIR/enkf$CDUMP.$gPDY/$gcyc"


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# Run relevant exglobal script
env
msg="HAS BEGUN on `hostname`"
postmsg "$jlogfile" "$msg"
$LOGSCRIPT


${ENKFRECENSH:-$SCRgsi/exglobal_enkf_recenter_fv3gfs.sh.ecf}
status=$?
[[ $status -ne 0 ]] && exit $status


##############################################
# End JOB SPECIFIC work
##############################################

##############################################
# Final processing
##############################################
if [ -e "$pgmout" ] ; then
  cat $pgmout
fi


msg="ENDED NORMALLY."
postmsg "$jlogfile" "$msg"


##########################################
# Remove the Temporary working directory
##########################################
cd $DATAROOT
[[ $KEEPDATA = "NO" ]] && rm -rf $DATA

date
exit 0