#!/bin/bash

# #### 08/25/1999 ###################
# SET SHELL PROCESSING VARIABLES
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set -x
export PS4=' $SECONDS + '
date

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# Make temp directory
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export DATA=${DATA:-${DATAROOT:?}/${jobid:?}}
mkdir -p $DATA
cd $DATA

export HOUR=$cyc
export cycle=t${cyc}z

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# Specify NET and RUN Name
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export NET=glmp
export RUN=glmp

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# Determine Diagnostic Output Name on System
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export pgmout="OUTPUT.$$"

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# Specify Execution Areas
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#export HOMEglmp=${HOMEglmp:-${OPSROOT}/glmp.${glmp_ver:?}}
export EXECglmp=${EXECglmp:-$HOMEglmp/exec}
export FIXglmp=${FIXglmp:-$HOMEglmp/fix}
export PARMglmp=${PARMglmp:-$HOMEglmp/parm}

#export HOMElamp_shared=${HOMElamp_shared:-${OPSROOT}/lamp_shared.${lamp_shared_ver:?}}
#export FIXlamp_shared=${FIXlamp_shared:-${HOMElamp_shared}/fix}

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# Run setpdy and initialize PDY variables
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setpdy.sh
. ./PDY

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# Setting date variables
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export DAT="$PDY$HOUR"
export DATm1=`$NDATE -1 $DAT`
export HOURm1=`printf $DATm1 | cut -c 9-10`
export PDYm1h=`echo $DATm1 | cut -c1-8`

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# Define COM directories
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export COMIN=${COMIN:-$(compath.py ${envir}/com/${NET}/${glmp_ver})/${RUN}.${PDY}}
export COMINm1h=${COMINm1h:-$(compath.py ${envir}/com/${NET}/${glmp_ver})/${RUN}.${PDYm1h}}
export COMINlmp=${COMINlmp:-$(compath.py ${envir}/com/lmp/${lmp_ver})/lmp.${PDY}}
export COMOUT=${COMOUT:-$(compath.py -o ${NET}/${glmp_ver})/${RUN}.${PDY}}
mkdir -m 775 -p $COMOUT

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# *****NOTE TO SPAS******
# This variable is needed by the script to determine which element
# to run for.  All elements can run as side-by-side parallel
# processes when JGLMP_00PREP has successfully completed.
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# Three possible elm arguments: tdp, cig, and vis
export elm=$ELEMENT
export MIN=$MIN

env

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# execute the script
#export OMP_NUM_THREADS=$NTHREAD         #take out overwritten function because EnvVars will set OMP_NUM_THREADS=1
#export KMP_AFFINITY=${KMP_AFFINITY:-balanced}
$HOMEglmp/scripts/exglmp_obs_granalysis_ak.sh
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cat $pgmout

if [ "${KEEPDATA^^}" != "YES" ]; then
   rm -rf $DATA
fi

date