#!/bin/bash
set -x

export RUN_ENVIR=${RUN_ENVIR:-"nco"}
export PS4='$SECONDS + '
date


#############################
# Source relevant config files
#############################
export EXPDIR=${EXPDIR:-$HOMEgfs/parm/config}
configs="base anal eupd"
config_path=${EXPDIR:-$NWROOT/gfs.${gfs_ver}/parm/config}
for config in $configs; do
    . $config_path/config.$config
    status=$?
    [[ $status -ne 0 ]] && exit $status
done


##########################################
# Source machine runtime environment
##########################################
. $HOMEgfs/env/${machine}.env eupd
status=$?
[[ $status -ne 0 ]] && exit $status


##############################################
# Obtain unique process id (pid) and make temp directory
##############################################
export pid=${pid:-$$}
export outid=${outid:-"LL$job"}
export DATA=${DATA:-${DATAROOT}/${jobid:?}}
mkdir -p $DATA
cd $DATA


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# Run setpdy and initialize PDY variables
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export cycle="t${cyc}z"
setpdy.sh
. ./PDY


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# Determine Job Output Name on System
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export pgmout="OUTPUT.${pid}"
export pgmerr=errfile


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# Set variables used in the script
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export CDATE=${CDATE:-${PDY}${cyc}}
export CDUMP=${CDUMP:-${RUN:-"gdas"}}
export COMPONENT=${COMPONENT:-atmos}


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# Begin JOB SPECIFIC work
##############################################

GDATE=$($NDATE -$assim_freq $CDATE)
gPDY=$(echo $GDATE | cut -c1-8)
gcyc=$(echo $GDATE | cut -c9-10)

export APREFIX="${CDUMP}.t${cyc}z."
export GPREFIX="gdas.t${gcyc}z."
export ASUFFIX=${ASUFFIX:-$SUFFIX}
export GSUFFIX=${GSUFFIX:-$SUFFIX}


# COMIN_GES_ENS and COMOUT_ANL_ENS are used in script
export COMIN_GES_ENS="$ROTDIR/enkfgdas.$gPDY/$gcyc/$COMPONENT"
export COMOUT_ANL_ENS="$ROTDIR/enkf$CDUMP.$PDY/$cyc/$COMPONENT"


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# Run relevant script
env
echo "HAS BEGUN on $(hostname)"
$LOGSCRIPT

${ENKFUPDSH:-$SCRgfs/exgdas_enkf_update.sh}
status=$?
[[ $status -ne 0 ]] && exit $status


##############################################
# Send Alerts
##############################################
if [ $SENDDBN = YES  ] ; then
   $DBNROOT/bin/dbn_alert MODEL ENKF1_MSC_enkfstat $job $COMOUT_ANL_ENS/${APREFIX}enkfstat
fi


##############################################
# End JOB SPECIFIC work
##############################################

##############################################
# Final processing
##############################################
if [ -e "$pgmout" ] ; then
  cat $pgmout
fi


echo "ENDED NORMALLY."


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# Remove the Temporary working directory
##########################################
cd $DATAROOT
[[ $KEEPDATA = "NO" ]] && rm -rf $DATA

date
exit 0