#!/bin/bash

echo "$(date -u) begin $(basename $BASH_SOURCE)"

set -xa
if [[ ${STRICT:-NO} == "YES" ]]; then
	# Turn on strict bash error checking
	set -eu
fi
export PS4='$SECONDS + $(basename $BASH_SOURCE))[$LINENO] '

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# Determine Job Output Name on System
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export jobid=${jobid:-"$job.$PBS_JOBID"}
export pgmout="OUTPUT.${PBS_JOBID}"
export pgmerr=errfile

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# Specify and create working directory
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export DATA=${DATA:-${DATAROOT}/${jobid}}
mkdir -p $DATA
cd $DATA

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# Specify NET and RUN Name and model
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export NET=${NET:-gefs}
export envir=${envir:-prod}
export RUN=${RUN:-gefs}

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# SENDCOM  - Copy Files From TMPDIR to $COMOUT
# SENDDBN  - Issue DBNet Client Calls
# SENDECF  - Flag Events on ECF
# VERBOSE  - Specify Verbose Output
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export SENDCOM=${SENDCOM:-YES}
export SENDDBN=${SENDDBN:-YES}
export SENDECF=${SENDECF:-YES}
export VERBOSE=${VERBOSE:-YES}

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# Set up the date information
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export cycle=t${cyc}z
setpdy.sh
source PDY

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# Specify Execution Areas
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export HOMEgefs=${HOMEgefs:-${PACKAGEROOT}/gefs.${gefs_ver}}
export PARMgefs=${PARMgefs:-$HOMEgefs/parm}

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# Define COM directories
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ver=${ver:-$(echo ${gefs_ver}|cut -c1-5)}
export COMPONENT=chem
export GESOUT=${GESOUT:-$(compath.py -o $NET/${ver})/${RUN}.${PDY}/$cyc/nwges}
mkdir -p $GESOUT

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# Source relevant config files
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configs="gefs gefs_prep_emissions"
config_path=$PARMgefs
for config in $configs; do
    . $config_path/$config.parm
    export err=$?
    if [[ $err != 0 ]]; then
        echo "FATAL ERROR in $(basename $BASH_SOURCE): Error while loading parm file $config_path/$config.parm"
        exit $err
    fi
done

export GBBEPX_DATA_DIR_TODAY=${GBBEPX_DATA_DIR_TODAY:-$DCOMROOT/$PDYm1/firewx}
export GBBEPX_DATA_DIR_YESTERDAY=${GBBEPX_DATA_DIR_YESTERDAY:-$DCOMROOT/$PDYm2/firewx}
export BBEM_MODIS_DIR_TODAY=${BBEM_MODIS_DIR_TODAY:-$DCOMROOT/$PDY/modis_fire}
export BBEM_MODIS_DIR_YESTERDAY=${BBEM_MODIS_DIR_YESTERDAY:-$DCOMROOT/$PDYm1/modis_fire}

echo "Environment before calling script"
env | sort

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# Execute the script
$HOMEchem/scripts/exglobal_prep_chem.sh
export err=$?
if [[ $err == 0 ]]; then
    echo "$job completed normally!"
else
    echo "FATAL ERROR in $(basename $BASH_SOURCE): $job failed!"
    exit $err
fi
#############################################################

##############################
# Remove the Temporary working directory
##############################
cd $DATAROOT
if [ ${KEEPDATA:-NO} = NO ] ; then rm -rf $DATA ; fi

echo "$(date -u) end $(basename $BASH_SOURCE)"

exit $err