#!/bin/sh 
set -xa
export MP_IOAGENT_CNT=all
export MP_IO_BUFFER_SIZE=8M

##########################################################################
# Runs NEMS GFS AEROSOL COMPONENT (NGAC) post-processing                 #
# Author: Sarah Lu ; Dec 20 2011                                         #
#                                                                        #
# REVISION HISTORY:                                                      #
#  16Jan2012 Sarah Lu     Add gocart_postout and mapping options         #
#  19Jan2012 Sarah Lu     Modify err_check                               #
#  09Feb2012 Jun Wang     Output AOD using PDT4.44 to seperate file      #
#  13Feb2012 Sarah Lu     Support OPT_FLE and OPT_PDT options            #
#  08Mar2012 Sarah Lu     Support OPT_LUMP option                        #
#  29Mar2012 Sarah Lu     Add ngac_para_config                           #
#  18Jun2012 Sarah Lu     Streamline the code to comply the NCO guideline#
##########################################################################

#
# Specify whether the run is production or development
#
export RUN_ENVIR=${RUN_ENVIR:-prod}
#

################################################################
# Specify NET and RUN Name and model
################################################################
export NET=${NET:-ngac}
export RUN=${RUN:-ngac}

################################################################
# Run config file to get input parameters for the developers
################################################################
if [ $RUN_ENVIR != prod ]                     ### For Developers
then

  . ${PARA_CONFIG:-/global/save/wx23lu/NGAC/nwprod_2jif/parm/ngac_para_config}

fi

################################################################
# This block can be modified for different test environment              
################################################################
if [ $RUN_ENVIR = prod -a $envir != prod ]; then
  export SENDDBN=${SENDDBN:-NO}
  export jlogfile=${jlogfile:-/com/logs/${envir}/jlogfile}
  export utilexec=${utilexec:-/nw${envir}/util/exec}
  export DBNROOT=/nwprod/spa_util/fakedbn
  export DBN_ALERT_TYPE=${DBN_ALERT_TYPE:-NGAC_AOD_GB2_PARA}
else
#  export LOGDIR=${DATA_IN}/logs
  export LOGDIR=/com/logs
  mkdir -m 775 -p $LOGDIR
  export jlogfile=${jlogfile:-${LOGDIR}/jlogfile}
fi

if [[ $RUN_ENVIR = prod || ${DEV_SMS:-YES} = YES ]] ; then     
   $SMSBIN/smsinit $LOADL_STEP_ID
fi

#

################################################################
# set up job name and environment
################################################################
export job=${job:-$RUN}
export envir=${envir:-prod}
export host=${host:-`hostname | cut -c1`}

################################################################
# SETUP NGAC PROCESSING VARIABLES
################################################################
export PS4='$SECONDS + '
date

################################################################
# obtain unique process id (pid) and make temp directory
################################################################
export pid=${pid:-$$}
export DATA_IN=${DATA_IN:-/tmpnwprd}
export DATA=${DATA:-$DATA_IN/${job}.${pid}}
mkdir -p $DATA
cd $DATA

export DATA_FCST=${DATA_FCST:-${DATA_IN}/ngac_forecast_00_${envir}}   ## working directory for fcst job

####################################
# Specify NGAC version number
####################################
NGAC_VERSION=${NGAC_VERSION:-${model_ver}}

################################################################
# Specify Execution Areas
################################################################
export HOMEngac=${HOMEngac:-/nw${envir}/ngac.${NGAC_VERSION}}
export EXECngac=${EXECngac:-$HOMEngac/exec}
export FIXngac=${FIXngac:-$HOMEngac/fix}
export USHngac=${USHngac:-$HOMEngac/ush}
export PARMngac=${PARMngac:-$HOMEngac/parm}
export SCRIPTDIR=${SCRIPTDIR:-$HOMEngac/scripts}

export HOMEGLOBAL=${HOMEGLOBAL:-/nw${envir}}
export EXECGLOBAL=${EXECGLOBAL:-$HOMEGLOBAL/exec}
export FIXGLOBAL=${FIXGLOBAL:-$HOMEGLOBAL/fix}
export USHGLOBAL=${USHGLOBAL:-$HOMEGLOBAL/ush}
export PARMGLOBAL=${PARMGLOBAL:-$HOMEGLOBAL/parm}

################################################################
# Specify CONFIG_FILE
################################################################
export CONFIG_FILE=${CONFIG_FILE:-$PARMngac/ngac_config}
[[ $(dirname $CONFIG_FILE) = . ]]&&CONFIG_FILE=$(pwd)/$CONFIG_FILE
if [[ ! -r $CONFIG_FILE ]];then
  echo $0: inaccessible configuration file $CONFIG_FILE >&2
  err_exit
fi


################################################################
# Determine Job Output Name on System
################################################################
export cyc=${cyc:-00}
export outid="LL$job"
export jobid="${outid}.o${pid}"
export pgmout="OUTPUT.${pid}"
export pgmerr=errfile
export cycle=t${cyc}z


################################################################
# SAVEGES  - Copy Files From TMPDIR to $GESdir
# SENDSMS  - Flag Events on SMS
# SENDCOM  - Copy Files From TMPDIR to $COMOUT
# SENDDBN  - Issue DBNet Client Calls
# RERUN    - Rerun prep from beginning (default no)
# VERBOSE  - Specify Verbose Output 
################################################################
export SAVEGES=${SAVEGES:-YES}
export SENDSMS=${SENDSMS:-YES}
export SENDCOM=${SENDCOM:-YES}
export SENDDBN=${SENDDBN:-YES}
export RERUN=${RERUN:-NO}
export VERBOSE=${VERBOSE:-YES}

################################################################
# DBN_ALERT_TYPE - dbn_alert type
################################################################
export DBN_ALERT_TYPE=${DBN_ALERT_TYPE:-NGAC_AOD_GB2}

################################################################
# Set up the UTILITIES
################################################################
export utilscript=${utilscript:-/nwprod/util/ush}
export utilexec=${utilexec:-/nwprod/util/exec}

export err_chk=${err_chk:-$utilscript/err_chk.sh}
export startmsg=${startmsg:-$utilscript/startmsg.sh}
export ERRSCRIPT=${ERRSCRIPT:-$err_chk}
export LOGSCRIPT=${LOGSCRIPT:-$startmsg}

################################################################
# Run setup to initialize working directory and utility scripts
################################################################
sh $utilscript/setup.sh
# export PDY=20120624
################################################################
# Run setpdy and initialize PDY variables
################################################################
sh $utilscript/setpdy.sh
. PDY

export CDATE=${CDATE:-${PDY}$cyc}

################################################################
# Get the variables setup from config script
################################################################
set -a; . $CONFIG_FILE; set +a

env

export MP_SHARED_MEMORY=${MP_SHARED_MEMORY:-no}
#
################################################################
# Define COM and GES directories
################################################################
export COM_IN=${COM_IN:-/com/${NET}/${envir}}
export COM_OUT=${COM_OUT:-/com/${NET}/${envir}}
export gespath=${gespath:-/nwges/${envir}}

export COMIN=${COMIN:-$COM_IN/${RUN}.${PDY}}
export COMOUT=${COMOUT:-$COM_OUT/${RUN}.${PDY}}
export GESdir=${GESdir:-$gespath/${RUN}.${PDY}}

mkdir -m 775 -p $COMOUT
mkdir -m 775 -p $GESdir


##### --------- post job starts here --------------------------------

msg="NGAC_POST HAS BEGUN on`hostname`"
$DATA/postmsg "$jlogfile" "$msg"

################################################################
# Define NEMS-GFS History File Names
################################################################
export SIGO=$COMOUT/${RUN}.${cycle}.sigf
export FLXO=$COMOUT/${RUN}.${cycle}.flxf
export D3DO=$COMOUT/${RUN}.${cycle}.d3df
export AERO=$COMOUT/${RUN}.${cycle}.aerf

################################################################
# Define NGAC Post File Names
################################################################
export A2DO=${A2DO:-$COMOUT/${RUN}.${cycle}.a2df}
export A3DO=${A3DO:-$COMOUT/${RUN}.${cycle}.a3df}
export AOD01=${AOD01:-$COMOUT/${RUN}.${cycle}.aod_550nm}
export AOD02=${AOD02:-$COMOUT/${RUN}.${cycle}.aod_340nm}
export AOD03=${AOD03:-$COMOUT/${RUN}.${cycle}.aod_440nm}
export AOD04=${AOD04:-$COMOUT/${RUN}.${cycle}.aod_660nm}
export AOD05=${AOD05:-$COMOUT/${RUN}.${cycle}.aod_860nm}
export AOD06=${AOD06:-$COMOUT/${RUN}.${cycle}.aod_1p63um}
export AOD07=${AOD07:-$COMOUT/${RUN}.${cycle}.aod_11p1um}

################################################################
# Execute the script.
################################################################
msg="Submit NGAC Post"
postmsg "$jlogfile" "$msg"
export POST_SCRIPT_DIR=${POST_SCRIPT_DIR:-$SCRIPTDIR}
export POST_SCRIPT=${POST_SCRIPT:-$POST_SCRIPT_DIR/exngac_post.sh.sms}
$POST_SCRIPT

##### --------- post job ends here -----------------------------------

###################################################
# msg end of job and clean up temperary directory
###################################################
msg="ENDED NORMALLY."
postmsg "$jlogfile" "$msg"

cd $DATA_IN
if [ ${RM_TMPDIR:-YES} = YES ] ; then rm -rf $DATA $DATA_FCST ; fi

date

if [[ $RUN_ENVIR = prod || ${DEV_SMS:-YES} = YES ]] ; then $SMSBIN/endt ; fi